Sau khi đánh bại trùm cuối của thế giới ảo Alleyzard, Ohtorizawa Akatsuki trở về thế giới thực và cư ngụ tại tổ chức BABEL – 1 tổ chức bảo về những người được chuyển về từ thế giới bên ngoài. Akatsuki khi trở về còn mang theo con gái của trùm cuối Satan là Miu. Tại BABEL, cậu trạm trán với những người chơi khác có những sức mạnh siêu nhiên.
50 năm trước, một phù thuỷ quyền năng đã chết và để lại một thứ được gọi là "Di sản của phủ thuỷ". Tương truyền rằng nếu ai có thể hoàn thành việc thu thập "99 mảnh phù thuỷ" sẽ được ban cho một điều ước. Và 50 năm sau câu chuyện bắt đầu từ đây
Năm 2022, loài người cuối cùng cũng mô phỏng được thế giới ảo một cách hoản hảo. Bên trong một VRMMORPG (game thực tế ảo trực tuyến nhiều người chơi) Sword Art Online, có một người tên Kirito, trong khi cậu ta đang thích thú tận hưởng thế giới SAO, cậu ta và hơn 10.000 players khác nhận được một tin nhắn khủng khiếp của Game Master – theo đó, cách duy nhất để thoát khỏi thế giới ảo này là clear game, và game over đồng nghĩa với cái chết ngoài thế ...
Yuji là 1 học sinh năm 1 cấp 3, có 1 cuộc sống bình thường như bao người khác. 1 ngày nọ, cậu bỗng nhiên nhìn thấy được những thứ mà người thường ko thể nhìn thấy, y chang trong 1 quyển sách mà cậu đọc được... Và cuộc đời cậu cũng thay đổi cùng với cái ngày mà cậu bị bọn yêu quái tấn công, 1 cô gái với mái tóc, đôi mắt đỏ, cầm thanh katana xuất hiện... Cuộc đời cậu sẽ như thế nào cùng cô gái bí ẩn đó ?!