Năm 2022, loài người cuối cùng cũng mô phỏng được thế giới ảo một cách hoản hảo. Bên trong một VRMMORPG (game thực tế ảo trực tuyến nhiều người chơi) Sword Art Online, có một người tên Kirito, trong khi cậu ta đang thích thú tận hưởng thế giới SAO, cậu ta và hơn 10.000 players khác nhận được một tin nhắn khủng khiếp của Game Master – theo đó, cách duy nhất để thoát khỏi thế giới ảo này là clear game, và game over đồng nghĩa với cái chết ngoài thế ...
Năm 2022, công ty điện tử ARGUS sáng chế ra thiết bị có thể điều khiển hoạt động của não bộ mang tên NERvGear, giúp cho các trò chơi thực tế ảo trở thành hiện thực. Nhân vật chính Kirito cùng hơn 9500 người chơi khác được “may mắn” trải nghiệm Sword Art Online – game VRMMORPG đầu tiên trên thế giới ngay từ khi nó chính thức hoạt động, nhưng lại không thể ngờ rằng nó cũng chính là cái bẫy chết người sẽ khiến cuộc sống của họ hoàn toàn thay ...
Sau khi đánh bại trùm cuối của thế giới ảo Alleyzard, Ohtorizawa Akatsuki trở về thế giới thực và cư ngụ tại tổ chức BABEL – 1 tổ chức bảo về những người được chuyển về từ thế giới bên ngoài. Akatsuki khi trở về còn mang theo con gái của trùm cuối Satan là Miu. Tại BABEL, cậu trạm trán với những người chơi khác có những sức mạnh siêu nhiên.
50 năm trước, một phù thuỷ quyền năng đã chết và để lại một thứ được gọi là "Di sản của phủ thuỷ". Tương truyền rằng nếu ai có thể hoàn thành việc thu thập "99 mảnh phù thuỷ" sẽ được ban cho một điều ước. Và 50 năm sau câu chuyện bắt đầu từ đây
